Abstract The development of living beings depends on the health and chemical quality of the available water. In recent years, the importance of the environment in the spread of resistant and multi-resistant bacteria to antibiotics has been observed, a situation that has placed the problem of antibiotic resistance on a broader level and which is being studied from the perspective “One Health”. The objective of this work was to determine the presence of multi-resistant bacteria to antibiotics in irrigation water samples from the Chibunga river. Fourteen water samples of 100 mL each were collected in sterile containers and aseptically, were kept under refrigeration until analysis in the laboratory. Each sample was seeded by the surface seeding method on blood, cystine electrolyte deficient, MacConkey, Salmonella-Shigella and thiosulfate citrate bile sucrose agars, incubating in all cases at a temperature of 37 °C for a maximum time of 48 hours. The identification of bacterial colonies was carried out through physiological and biochemical tests according to the identification schemes indicated by MacFaddin. The resistance/sensitivity to antibiotics of the identified colonies was carried out by the disk diffusion method of Kirby Bauer. Two species of multi-resistant bacteria were identified, including strains of Morganella morgani and Plesiomonas shigelloides resistant to antibiotics of clinical use such as ceftazidime, aztreonam, ciprofloxacin, nalidixic acid and trimethoprim-sulfamethoxazole. The results show that the waters of Chibunga river harbor bacteria with multi-resistance to antimicrobials, representing a contamination risk of agricultural products harvested in its vicinity, as well as for the people who use these waters.

Resumen El bienestar y desarrollo de los seres vivos depende de la calidad sanitaria y química del agua disponible. En los últimos años se ha venido observando la importancia del ambiente en la diseminación de bacterias resistentes y multirresistentes a los antibióticos, situación que ha colocado la problemática de la resistencia en un plano más amplio y que se está estudiando desde la perspectiva “One Health”. En este sentido, el objetivo del presente trabajo fue determinar la presencia de bacterias multirresistentes a los antibióticos en muestras de agua de riego provenientes del río Chibunga. Se recolectaron 14 muestras de agua de un volumen de 100 mL cada una, en envases estériles y de manera aséptica, las cuales fueron conservadas bajo refrigeración hasta su análisis en el laboratorio. Cada muestra fue sembrada por el método de siembra en superficie en los agares cistina electrolito deficiente, MacConkey, Salmonella-Shigella, tiosulfato citrato bilis sacarosa y agar sangre, incubándose en todos los casos a una temperatura de 37 °C durante un tiempo máximo de 48 horas. La identificación de las colonias bacterianas se realizó mediante pruebas fisiológicas y bioquímicas de acuerdo con los esquemas de identificación indicados por MacFaddin. El perfil de susceptibilidad a los antibióticos de las colonias identificadas se realizó por el método de difusión en disco de Kirby Bauer. Se lograron identificar 2 especies de bacterias multirresistentes, entre ellas, cepas de Morganella morganii y Plesiomonas shigelloides resistentes a antibióticos de uso clínico como ceftazidima, aztreonam, ciprofloxacino, ácido nalidíxico y trimetroprim-sulfametoxazol. Los resultados muestran que las aguas del río Chibunga albergan bacterias con multirresistencia a los antimicrobianos, representando un riesgo de contaminación de los productos agrícolas cosechados en sus inmediaciones, así como para las personas que utilizan estas aguas.

Resumo O impacto dos antibióticos no crescimento e na produção do casulo foi avaliado, além do isolamento e caracterização das bactérias associadas ao intestino de larvas infectadas do bicho-da-seda. A criação das larvas foi mantida nas condições recomendadas de temperatura e umidade. As larvas do bicho-da-seda com sintomas anormais foram coletadas do grupo controle e dissecadas para coleta do intestino. As bactérias foram isoladas do conteúdo intestinal por espalhamento em placas de ágar e incubadas a 37° C durante 48 horas. A identificação bacteriana e a análise filogenética foram realizadas pelo sequenciamento do gene 16S rRNA. As bactérias isoladas foram submetidas a teste de sensibilidade antimicrobiana (métodos de difusão em disco) com penicilina (10 µg / mL), tetraciclina (30 µg / mL), amoxicilina (25 µg / mL), ampicilina (10 µg / mL) e eritromicina (15 µg / mL). Todas as cepas isoladas apresentaram resultados positivos para o teste da catalase. Isolamos e identificamos cepas bacterianas (n = 06) do intestino de larvas de bicho-da-seda saudáveis e doentes. Com base na sequência do gene 16S rRNA, as bactérias isoladas mostraram estreita relação com Serratia, Bacillus e Pseudomonas spp. Notavelmente, 83,3% das cepas eram resistentes a penicilina, tetraciclina, amoxicilina, ampicilina e eritromicina, mas 16,6% mostraram suscetibilidade aos antibióticos comumente usados mencionados acima. As larvas do bicho-da-seda alimentadas com folhas tratadas com penicilina apresentaram melhora significativa no peso larval, comprimento larval e produção de casulo. Peso larval significativamente maior (6,88g), comprimento larval (5,84cm) e peso do casulo (1,33g) foram registrados para larvas alimentadas com folhas tratadas com penicilina, em comparação com outros antibióticos. Cepas bacterianas isoladas mostraram estreita relação com Serratia spp., Bacillus spp. e Pseudomonas spp.

Abstract The impact of antibiotics on growth, cocoon production was assessed in addition to isolation and characterization of bacteria associated with silkworm gut of infected larvae. Larval rearing was maintained at recommended conditions of temperature and humidity. Silkworm larvae showing abnormal symptoms were collected from the control group and dissected for gut collection. Bacteria were isolated from the gut content by spreading on agar plates and incubated at 37 °C for 48 hrs. Bacterial identification and phylogenetic analysis were carried out by 16S rRNA gene sequencing. The isolated bacteria were subjected to antimicrobial susceptibility test (disc diffusion methods) by using Penicillin (10 µg/mL), Tetracycline (30 µg/mL), Amoxicillin (25 µg/mL), Ampicillin (10 µg/mL), and Erythromycin (15 µg/mL). All isolated strains showed positive results for the catalase test. We isolated and identified bacterial strains (n = 06) from the gut of healthy and diseased silkworm larvae. Based on the 16S rRNA gene sequence, isolated bacteria showed close relation with Serratia, Bacillus, and Pseudomonas spp. Notably, 83.3% of strains were resistant to Penicillin, Tetracycline, Amoxicillin, Ampicillin, and Erythromycin but 16.6% showed antibiotic susceptibility to the above-mentioned commonly used antibiotics. Silkworm larvae fed on penicillin-treated leaves showed significant improvement in larval weight, larval length, and cocoon production. Significantly higher larval weight (6.88g), larval length (5.84cm), and cocoon weight (1.33g) were recorded for larvae fed on leaves treated with penicillin as compared to other antibiotics. Isolated bacterial strains showed close relation with Serratia spp., Bacillus spp. and Pseudomonas spp.

Resumo O presente estudo foi realizado para isolar e caracterizar bactérias de amostras de água e solo retiradas do Canal Lahore, em Lahore, em diferentes locais, ou seja, Mall Road, Mohlanwal e Khera. As cepas bacterianas isoladas foram identificadas com base em testes morfológicos e bioquímicos. A identificação foi confirmada por cultura de bactérias em testes de meios seletivos. O teste de resistência aos antibióticos também foi realizado para observar a resistência das bactérias a diferentes antibióticos. Foi realizado o teste de ágar sangue para identificar diferentes bactérias patogênicas. O resultado revelou que amostras de água e solo do Canal Lahore, Lahore, de diferentes localidades estavam contaminadas com Escherichia coli, Salmonella sp., Vibrio sp., Bacillus spp., Enterococcus sp. e Staphylococcus spp. Por causa da presença desses patógenos, essa água não é adequada para qualquer uso doméstico e de irrigação. O estudo revelou que a água do Canal Lahore é prejudicial à saúde humana, pois está contaminada com bactérias que podem causar doenças graves, por exemplo: Escherichia coli pode ocasionar gastroenterite; Bacillus spp. pode causar náuseas e vômitos; Enterococcus sp. pode infectar o trato urinário; Salmonella sp. é responsável pela bacteremia; Staphylococcus spp. pode causar febre leve; e Vibrio sp. pode ser a razão da cólera. Assim, torna-se imprópria para uso humano, como natação, banho, lavagem etc., até que algumas medidas corretivas sejam empregadas para erradicar microrganismos patogênicos por WASA e LWMS de acordo com os padrões da OMS. Da mesma forma, é bastante prejudicial, quando usada para irrigação sem tratamento adequado.

Abstract The present study was conducted to isolate and characterize bacteria from water and soil sample taken from the Lahore Canal at different sites i.e. Mall Road, Mohlanwal and Khera site. Isolated bacterial strains were identified on the basis of morphological and biochemical tests. Identification was confirmed by culturing bacteria on selective media. Antibiotic resistance test was also performed to observe the resistance of bacteria against different antibiotics. Blood agar test was performed for identification of different pathogenic bacteria. The result revealed that water and soil samples of Lahore Canal Lahore from different sites were contaminated with Escherichia coli, Salmonella sp., Vibrio sp., Bacillus spp., Enterococcus sp. and Staphylococcus spp. Due to presence of these pathogens, this water is not suitable for any domestic and irrigation use. Study also revealed that water of the Lahore Canal is harmful for human health as it is contaminated with bacteria that can cause severe disease e.g., Escherichia coli can cause gastroenteritis, Bacillus spp. can cause nausea and vomiting, Enterococcus may infect urinary tract, Salmonella sp. is responsible for Bacteremia, Staphylococcus spp. can cause mild fever and Vibrio sp. can be the reason of cholera. Thus it is rendered unfit for any kind of human use even other than drinking like swimming, bathing, washing etc., until and unless some remedial measures are employed to eradicate pathogenic microorganisms by WASA and LWMS according to standards of WHO. Similarly, it is quite harmful, when and where ever it is used for irrigation without proper treatment.

Resumo Devido à extensa aplicação de antibióticos como promotores de crescimento na alimentação animal, a resistência aos antimicrobianos aumentou. Para superar esse desafio, os microbiologistas do rúmen buscam novos probióticos para melhorar a produtividade do gado. O presente estudo teve como objetivo isolar e avaliar bactérias lácticas específicas de raças (BAL) como potenciais probióticos animais. 12 cepas foram isoladas de diferentes amostras, incluindo leite, rúmen e fezes de búfalos Nilli Ravi. Esses isolados foram avaliados quanto ao seu potencial antimicrobiano contra patógenos animais comuns (Bacillus spp., E. coli, Staphylococcus aureus, Salmonella spp., Listeria spp.). Todos os isolados foram identificados por meio do sequenciamento do gene 16S rRNA e as análises filogenéticas inferiram que essas cepas apresentaram estreita relação com as espécies de vários gêneros; Enterococcus lactis, Pediococcus pentosaceus, Bacillus subtilis, Weissella cibaria, Weissella soli, Bacillus tequilensis, Weissella bombi, Bacillus licheniformis, Lactococcus lactis, Bacillus megaterium, Lactobacillus ruminis e Lactococcus lactis. O perfil probiótico dos isolados foi obtido usando critérios padrão, particularmente com propriedades probióticas animais.

Abstract Due to extensive application of antibiotics as growth promoters in animal feed, antimicrobial resistance has been increased. To overcome this challenge, rumen microbiologists search for new probiotics to improve the rate of livestock production. The present study was aimed to isolate and evaluate breed-specific lactic acid bacteria (LAB) as potential animal probiotics. The current study was conducted during 10 months from July 2020 to April 2021, in which a total of n=12 strains were isolated from different samples including milk, rumen, and feces of Nilli Ravi Buffaloes. These isolates were evaluated for their antimicrobial potential against common animal pathogens (Bacillus spp., E. coli, Staphylococcus aureus, Salmonella spp., Listeria spp.). All the isolates were identified using 16S rRNA gene sequencing and the phylogenetic analyses inferred that these strains showed close relations to the species of various genera; Enterococcus lactis, Pediococcus pentosaceus, Bacillus subtilis Weissella cibaria, Weissella soli, Bacillus tequilensis, Weissella bombi, Bacillus licheniformis, Lactococcus lactis, Bacillus megaterium, Lactobacillus ruminis, and Lactococcus lactis. NMCC-Ru2 has exhibited the enormous potential of antimicrobial activity, 28 mm, for Salmonella typhimurium;23 mm for Listeria monocytogenes 21 mm for E.coil. Highest resistance was seen in NMCC-Ru2 agasint test antbiotic, like 25.5 mm for Tetracycline. Overall results revesl that the probiotic profile of isolates was achieved using standard criteria, particularly with animal probiotic properties

Resumo A presença de bactérias patogênicas em alimentos é considerada a principal causa de doenças transmitidas por alimentos e deterioração da qualidade dos alimentos em todo o mundo. O presente estudo teve como objetivo determinar a eficácia de cinco óleos essenciais (OEs) contra patógenos de origem alimentar multirresistentes. No presente estudo, bactérias Gram-negativas (Escherichia, Enterobacter, Citrobacter, Proteus, Pseudomonas e Klebsiella) e as bactérias Gram-positivas Staphylococcus foram isoladas do leite cru e caracterizadas bioquimicamente. O efeito antibacteriano de diferentes antibióticos e OEs (tomilho, orégano, capim-limão, hortelã e alecrim) foi determinado usando o método padrão de difusão em disco. O estudo do antibiograma revelou que as bactérias Gram-negativas eram altamente resistentes à penicilina, enquanto o Staphylococcus era resistente à estreptomicina, amoxicilina e lincomicina. Foi observada resistência moderada à doxiciclina, amicacina, enrofloxacina, canamicina e cefixima. Os isolados foram encontrados menos resistentes à gentamicina, cloranfenicol e ciprofloxacina. Os OEs mostraram uma ampla gama de atividade antimicrobiana contra todas as bactérias, exceto P. aeruginosa. Destes, o tomilho foi mais eficaz contra a maioria das cepas bacterianas multirresistentes e formou a maior zona de inibição (26 mm) contra Escherichia seguido de óleo de orégano (18 mm) contra Staphylococcus (p<0,05). Klebsiella spp e Citrobacter spp apresentaram resistência ao óleo de menta e capim-limão, respectivamente. Os OEs como capim-limão, hortelã e alecrim foram menos ativos contra todas as bactérias. Os resultados do estudo recente sugerem o uso de OEs como agentes antibacterianos naturais para conservação de alimentos.

Abstract The presence of pathogenic bacteria in food is considered as a primary cause of food-borne illness and food quality deterioration worldwide. The present study aimed to determine the effectiveness of five essential oils (EOs) against multidrug-resistant foodborne pathogens. In the current study Gram-negative bacteria (Escherichia, Enterobacter, Citrobacter, Proteus, Pseudomonas, and Klebsiella) and the Gram-positive bacteria Staphylococcus were isolated from raw milk and biochemically characterized. The anti-bacterial effect of different antibiotics and EOs (thyme, oregano, lemongrass, mint, and rosemary) was determined using the standard disc diffusion method. The antibiogram study revealed that Gram-negative bacteria were highly resistant to penicillin while Staphylococcus was resistant to streptomycin, amoxicillin, and lincomycin. Moderate resistance was observed to doxycycline, amikacin, enrofloxacin, kanamycin and cefixime. Isolates were found less resistant to gentamycin, chloramphenicol, and ciprofloxacin. EOs showed a broad range of antimicrobial activity against all bacteria except P. aeruginosa. Of these, thyme was more effective against most of the multi-drug resistant bacterial strains and formed the largest zone of inhibition (26 mm) against Escherichia followed by oregano oil (18 mm) against Staphylococcus (p<0.05). Klebsiella spp and Citrobacter spp showed resistance to mint and lemongrass oil respectively. The EOs such as lemongrass, mint and rosemary were less active against all the bacteria. The findings of the recent study suggest the use of EOs as natural antibacterial agents for food preservation.

ABSTRACT: Tomato plants are a crop of great economic importance worldwide. Mexico is considered the world’s leading exporter of this vegetable, with a 24% market share. However, this crop can be affected by diseases such as bacterial freckle and bacterial cancer that can be introduced to plantations through infected seeds. Pesticides are used in agriculture for disease control and are considered a source of environmental pollution. Alternatives to the use of pesticides must therefore be sought. To this effect, electrolyzed water is a technology that has been shown to have antimicrobial activity. In this study, the antimicrobial activity of electrolyzed water on Pseudomonas syringaepv. tomato and Clavibactermichiganensis subsp.michiganensis was evaluated on cells suspension and tomato seed germination. Electrolyzed oxidizing water (EOW) and electrolyzed reduced water (ERW) treatments were applied for 1, 3 and 6 minutes. In addition, seeds were infected with each of the bacterial strains separately and electrolyzed water treatments were applied. Results show that oxidizing water is more efficient as an antimicrobial agent, as it achieved 100% growth reduction of the two bacterial strains after one minute of treatment. These treatments did not affect germination percentage, since germination percentages above 90% were obtained in all treatments and the seedlings were not affected in any of the evaluated variables.

RESUMO: O tomate é uma colheita de grande importância econômica em todo o mundo. O México é considerado o primeiro exportador desta hortaliça no mundo, com 24% de participação. No entanto, esta cultura pode ser afetada por doenças como a mancha bacteriana e o cancro bacteriano que podem ser introduzidos nas colheitas através de sementes infectadas. Os agrotóxicos são utilizados na agricultura para controlar doenças e são considerados uma fonte de contaminação ambiental. Por esse motivo, é necessário buscar alternativas ao uso de agrotóxicos. Nesse sentido, a água eletrolisada é uma tecnologia que tem demonstrado atividade antimicrobiana. No presente estudo, a atividade antimicrobiana da água eletrolisada sobre Pseudomonas syringae pv. tomate e Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis emcélulasem suspensão e na germinação de sementes de tomate. Os tratamentos com água eletrolisada oxidante e redutora foram aplicados por 1, 3 e 6 minutos. Por outro lado, as sementes foram infectadas com cada uma das cepas bacterianas de forma independente e foram aplicados tratamentos com água eletrolisada. Os resultados mostram que a água oxidante é mais eficiente como agente antimicrobiano, pois conseguiu uma redução de 100% no crescimento das duas cepas bacterianas após um minuto de tratamento. Os tratamentos não afetaram a porcentagem de germinação, pois em todos os tratamentos obtiveram-se porcentagens de germinação acima de 90% e as plântulas não foram afetadas em nenhuma das variáveis estudadas.

Abstract Indiscriminate use of highly toxic pesticides in agriculture has produced soil contamination and deterioration of ecosystems. A promising solution to this environmental problem is bioremediation, which includes the use of bacteria to degrade contaminating substances. (Objective): The objective of this work was to isolate, identify, and characterize bacterial strains capable of degrading the pesticides chlorothalonil and chlorpyrifos to determine their potential use in bioremediation of contaminated soils. (Methodology): The strains were isolated from agricultural soils using enrichment cultures containing chlorothalonil or chlorpyrifos (20 mg/L) as the sole carbon source. The isolated strains were characterized by their morphology, by their physiological responses to 48 biochemical tests and sensitivity to 1 antibiotics, by their growth kinetics, and in molecular terms (amplification of the gene rDNA 16S). (Results): In total, three strains were isolated, one capable of using (and degrading) chlorpyrifos, identified as Stenotrophomonas maltophilia, and two bacterial strains with a partial ability to use chlorothalonil as a carbon source, identified as Enterobacter cloacae and Ochrobactrumanthropi. The three bacterial species are Gram-negative bacilli and have diverse physiological characteristics, including variable resistance to certain antibiotics. (Conclusion): It is concluded that the isolated bacteria have biotechnological potential to be incorporated into a bioremediation strategy for contaminated soils, especially for the elimination of chlorpyrifos. Finally, further research perspectives are proposed to determine more efficient processes of chlorothalonil degradation by cometabolism.

Resumen El uso indiscriminado de plaguicidas altamente tóxicos en la agricultura ha producido contaminación de los suelos y deterioro de los ecosistemas. Una solución prometedora para este problema ambiental es la biorremediación, que incluye el uso de bacterias para degradar estas sustancias contaminantes. (Objetivo): El presente trabajo tuvo por objetivo el aislamiento, identificación y caracterización de cepas bacterianas con capacidad de degradar los plaguicidas clorotalonil y clorpirifos, para su potencial uso en la biorremediación de suelos contaminados. (Metodología): Las cepas fueron aisladas de suelos agrícolas mediante cultivos de enriquecimiento, que contenían clorotalonil o clorpirifos (20 mg/L) como única fuente de carbono. Las cepas aisladas se caracterizaron por su morfología, fisiológicamente por su respuesta a 48 pruebas bioquímicas y frente a 15 antibióticos, cinética de crecimiento, y molecularmente (amplificación del gen ADNr 16S). (Resultados): Se aisló una cepa bacteriana capaz de utilizar (y degradar) clorpirifos como fuente de carbono, identificada como Stenotrophomonas maltophilia y dos cepas bacterianas con capacidad parcial de utilizar clorotalonil como fuente de carbono, identificadas como Enterobacter cloacae y Ochrobactrum anthropi. Las tres especies bacterianas son bacilos Gram negativo y presentaron características fisiológicas diversas, incluyendo resistencia variable a ciertos antibióticos. (Conclusión): Se concluye que las bacterias aisladas tienen potencial biotecnológico para ser incorporadas en una estrategia de biorremediación de suelos contaminados, especialmente para eliminación de clorpirifos. Finalmente, se plantean perspectivas de investigación a futuro para dilucidar procesos más eficientes de degradación de clorotalonil mediante cometabolismo.

Resumo O uso indiscriminado de pesticidas altamente tóxicos na agricultura tem causado contaminação do solo e deterioração dos ecossistemas. Uma solução promissora para esse problema ambiental é a biorremediação, que inclui o uso de bactérias para decompor essas substâncias poluentes. (Objetivo): O objetivo deste trabalho foi o isolamento, identificação e caracterização de cepas bacterianas com capacidade de degradar os agrotóxicos clorotalonil e clorpirifós, para seu potencial uso em biorremediação de solos contaminados. (Metodologia): As cepas foram isoladas de solos agrícolas por meio de culturas de enriquecimento, que continham clorotalonil ou clorpirifós (20 mg/L) como única fonte de carbono. As cepas isoladas foram caracterizadas quanto à morfologia, fisiologica ente pela resposta a 48 testes bioquímicos e contra 15 antibióticos, cinética de crescimento e molecularmente amplificação do gene 16S rRNA). (Resultados): Foram isoladas uma cepa bacteriana capaz de utilizar (e decompor) o clorpirifós como fonte de carbono, identificada como Stenotrophomonas maltophilia, e duas cepas bacterianas com capacidade parcial de utilizar o clorotalonil como fonte de carbono, identificadas como Enterobacter cloacae e Ochrobactrum anthropi. As três espécies bacterianas são bacilos Gram-negativos e apresentaram diversas características fisiológicas, incluindo resistência variável a determinados antibióticos. (Conclusão): Conclui-se que as bactérias isoladas possuem potencial biotecnológico para serem incorporadas a uma estratégia de biorremediação de solos contaminados, principalmente para a eliminação de clorpirifós. Por fim, são levantadas perspectivas de pesquisas futuras para elucidar processos mais eficientes de degradação do clorotalonil por meio do cometabolismo.

Resumen Introducción: Rhizophora mangle se considera un nicho para microorganismos con enzimas degradantes potencialmente novedosas y complejas. Objetivo: Caracterizar poblaciones de Vibrio con métodos dependientes de cultivo, provenientes de muestras de sedimentos y de agua recolectadas a lo largo de un transecto de R. mangle compuesto por tres sitios. Métodos: Las cepas se caracterizaron según su distribución, diversidad, degradación de materia orgánica y parámetros ambientales. Resultados: Las densidades bacterianas estuvieron fuertemente asociadas con la temperatura y la salinidad. Un total de 87 secuencias de buena calidad que representan los aislamientos de los tres sitios se agruparon en 8 OTUs (Unidad taxonómica operativa). La asignación taxonómica indicó que los miembros dominantes eran Vibrionaceae. Los análisis de diversidad beta mostraron que las comunidades bacterianas se agruparon por fuente de la muestra en lugar de distribución espacial, y se encontró que la diversidad alfa era mayor en el agua que en los sedimentos. El 3 % de las cepas de muestras de agua fueron capaces de degradar carboxi-metilcelulosa con índices enzimáticos más bajos en comparación con el 4 % de las cepas de muestras de sedimentos que mostraron los índices enzimáticos más altos. Dos cepas identificadas como Vibrio agarivorans degradaron celulosa y agarosa, produciendo los índices enzimáticos más altos. Conclusiones: Encontramos mayor densidad bacteriana y diversidad en comunidades bacterianas de muestras de agua que en las de sedimento, con diferentes OTUs, incluyendo aquellos similares a Ferrimonas, Providencia, o Shewanella, que no fueron aislados en el sedimento. OTUs de Vibrio degradaron celulosa en ambos tipos de muestras. Los resultados del estudio resaltan la importancia de mangle rojo como hábitat de Vibrio y reservorio de fuentes potenciales de enzimas con aplicaciones biotecnológicas.

Abstract Introduction: Rhizophora mangle is considered an ecological niche for microorganisms with potentially novel and complex degrading enzymes. Objective: To characterize Vibrio populations using culture-dependent methods, using samples collected from sediments and water along a red mangrove transect composed of three sites. Methods: Strains were characterized according to their distribution, capacity to degrade of organic matter and other environmental parameters. Additionally the sequence diversity was assessed using 16S rRNA sequencing. Results: Bacterial densities were strongly associated with temperature and salinity. A total of 87 good-quality sequences representing the isolates from the three sites, were binned into eight OTUs (Operational taxonomic units). Taxonomic assignment indicated that the dominant members were Vibrionaceae. Beta diversity analyses showed that bacterial communities clustered by sample source rather than spatial distribution, and that alpha diversity was found to be higher in water than in sediment. Three percent of the strains from water samples could degrade carboxyl-methyl cellulose with the smallest enzymatic indexes compared to 4 % of the strains from sediment samples that showed the highest enzymatic indexes. Two strains identified as Vibrio agarivorans degraded cellulose and agarose, producing the highest enzymatic indexes. Conclusions: We found higher bacterial densities and diversity in the bacterial communities of the water samples compared to the sediment, with different OTUs including those similar to Ferrimonas, Providencia, or Shewanella which were not isolated in the sediment. Vibrio OTUs were shown to degrade cellulose in both sample types. The results of this study highlight the importance of red mangroves as Vibrio habitats and as reservoirs of potential enzyme sources with biotechnological applications.

Resumen Introducción. Rhizobium ha sido utilizado como estimulador del crecimiento en leguminosas. Diferentes especies de este grupo se asocian al garbanzo (Cicer arietinum L.), por lo que resulta importante obtener aislados con capacidad de beneficiar su crecimiento y productividad. Objetivo. Seleccionar e identificar aislados de Rhizobium sp. en cuanto a sus atributos como rizobacterias promotoras del crecimiento vegetal con mayor efectividad en su asociación a cultivares de garbanzo. Materiales y métodos. Los estudios se realizaron entre los años 2017-2020, en el Instituto de Investigaciones Fundamentales en Agricultura Tropical “Alejandro de Humboldt”, La Habana, Cuba. Se identificaron por secuenciación del gen 16S ARN tres cepas de rizobios, obtenidas de nódulos de garbanzo y se caracterizaron por su potencial como bacterias promotoras del crecimiento vegetal. Se realizó un experimento en condiciones de campo en dos campañas para demostrar su efectividad en la interacción con las plantas. Para los experimentos en condiciones de laboratorio se utilizó un diseño completamente aleatorizado, mientras que los ensayos en campo se realizaron bajo un diseño de bloques al azar, en ambos casos se realizó un análisis de varianza. Resultados. Las tres cepas bacterianas asociadas al garbanzo e identificadas como Rhizobium sp., fijaron nitrógeno atmosférico, solubilizaron fosfato de calcio, liberaron fitohormonas y fueron capaces de inhibir el crecimiento de Fusarium oxysporum, Fusarium incarnatum y Fusarium moniliforme. La inoculación en el garbanzo, incrementó la nodulación y las variables de rendimiento del cultivo número de vainas por planta y masa fresca de los granos (g). Conclusión. Se identificaron cepas de Rhizobium sp. con atributos como bacterias promotoras del crecimiento vegetal asociadas a cultivares nacionales de garbanzo que incrementaron su nodulación y rendimiento.

Abstract Introduction. Rhizobium has been used as a growth stimulator in leguminous. Different species of this group are associated with chickpea (Cicer arietium L.), so it is important to obtain isolated with capacity of benefitting their growth and productivity. Objective. To select and identify isolates of Rhizobium sp. in terms of their attributes as plant growth-promoting rhizobacteria with greater effectiveness in their association with chickpea cultivars. Materials and methods. The studies were carried out during the years 2017-2020, at the Instituto de Investigaciones Fundamentales en Agricultura Tropical “Alejandro of Humboldt”, Havana, Cuba. Three rhizobia strains, obtained from chickpea nodules were identified by 16S RNA gene sequencing and characterized for their potential as growth-promoting bacteria. An experiment was carried out in field conditions in two campaigns to demonstrate their effectiveness in the interaction with plants. For the experiments under laboratory conditions a completely randomized design was used, while the field trials were conducted under a randomized block design, in both cases an analysis of variance was performed. Results. The three bacterial strains associated with chickpea and identified as Rhizobium sp. fixed atmospheric nitrogen, solubilized calcium phosphate, released phytohormones and were able to inhibit the growth of Fusarium oxysporum, Fusarium incarnatum, and Fusarium moniliforme. Inoculation in chickpea increased the nodulation and the crop yield variables such as number of pods per plant and fresh grain mass (g). Conclusions. Rhizobium sp. strains were identified with attributes as plant growth-promoting bacteria associated with national chickpea cultivars, that increased their nodulation and yield.

Abstract Pneumonic pathologies are clinically important in alpaca breeding; however, there is little information about pneumonic types and bacterial causes. The objective is to characterize pneumonias and bacteria causing pneumonias in neonates of dead alpacas in high Andean communities of Huancavelica, Peru. We sampled 365 dead alpaca pups under 45 days of age, from 10 communities, 216 of them were taken tracheal swabs for microbiological studies with peptone buffer because they were cases of pneumonia. Macroscopic identification of pneumonias was done by photodocumentation test. Pasteurellamultocida, Mannheimia haemolytica were grown on Colombia agar enriched with alpaca blood; Streptococcus pneumoniae on Brain Heart Infusion agar supplemented with alpaca blood and identified by morphological and microscopic characterization, biochemical reactions and optokine. It was found 59.8% of mortality due to pneumonia and 40.2% by other causes, characterizing pneumonia by inflammation 55.1%, 44.9% by lesion and subtypes: Exudative 9.5%, Suppurative 3.8%, Proliferative 42.3%, Lobar 17.8%, Interstitial 26.6%, isolating strains Streptococcus pneumoniae 43.7%, Mannheimia haemolytica 14.9%, Pasteurella multocida 20.9%, predominant associates Streptococcus pneumoniae-Pasteurella multocida 10.7%. High frequency of types and subtypes of pneumonia associated to Gram (+) bacteria were observed as causal of pneumonia in alpaca pups, with predominance in three high Andean communities of Huancavelica, Peru.

Resumen Las patologías neumónicas son de importancia clínica en crianza de alpacas; sin embargo, el conocimiento de tipos neumónicos y las causas bacterianas es muy limitado. El objetivo es caracterizar las neumonías y las bacterias causantes de neumonías en neonatos de alpacas muertas en comunidades altoandinas de Huancavelica, Perú. La muestra consistió en 365 crías muertas de alpacas menores de 45 días de edad, procedentes de 10 comunidades; se tomaron hisopados traqueales en 216 de ellas para estudios microbiológicos con buffer peptonada por resultar casos de neumonías. La identificación macroscópica de neumonías se hizo mediante el test foto documentador. Se cultivaron la Pasteurellamultocida y Mannheimiahaemolytica en agar Colombia enriquecidas con sangre de alpaca; Streptococcus pneumoniae en agar Infusión Cerebro Corazón suplementadas con sangre de alpaca e identificadas mediante caracterización morfológica, microscópica, reacciones bioquímicas y optoquina. Se encontraron 59,8% de mortalidad por neumonía y 40,2% por otras causas, caracterizándose neumonía por inflamación 55,1%; 44,9% por lesión y subtipos: Exudativa 9,5%, Supurativa 3,8%, Proliferativa 42,3%, Lobar 17,8%, Intersticial 26,6%, aislándose cepas de Streptococcus pneumoniae 43,7%, Mannheimiahaemolytica 14,9%, Pasteurellamultocida 20,9%, asociadas con Streptococcus pneumoniae-Pasteurella multocida 10,7%. Se evidenció una alta frecuencia de tipos, subtipos de neumonías asociados a bacterias Gram (+) como causales de neumonías en crías de alpaca con predomino en tres comunidades altoandinas de Huancavelica, Perú.

Resumo Uma das propiedades biológicas mais notáveis atribuídas aos probióticos é a sua atividade antimicrobiana. A investigação sobre probióticos está focado tradicionalmente em cepas individuais, porém, as combinações de cepas probióticas podem ter um espectro de ação mais amplo, ou efeitos de sinergia que potenciam sua ação de proteção. O objetivo desta investigação foi avaliar o efeito de sinergia de cepas de bacterias láticas, isoladas do leite materno de diferentes origens, na inibição de patógenos bacterianos importantes na medicina humana e animal. Sete combinações de cepas de pares de bacterias láticas foram usadas e o efeito de inibição contra patógenos bacterianos Escherichia coli ATCC 25922, Salmonella enterica ATCC 13076, Klebsiella pneumoniae ATCC 13883, e Acinetobacter baumannii ATCC 19606 e uma cepa de E. coli enterohemorrágica. A combinação das cepas TUCO-5E + TUCO-L2 foi a mais efetiva na inibição do crescimento de todos os patógenos avaliados, destacando o efeito contra K. pneumoniae e A. baumannii. Cinco combinações apresentaram efeito de sinergia na inibição de patógenos extraintestinais: a) efeito de sinergia das cepas TUCO-5E + TUCO-L2 na inibição de K. pneumoniae . A. baumannii, b) efeito de sinergia das cepas TUCO-5E + TUCO-2, TUCO-5 + TUCO-2, e TUCO-3 + TUCO-17 contra K. pneumoniae e c) efeito de sinergia das cepas TUCO-16 + TUCO-17 contra A. baumannii. As combinações das cepas que apresentaram sinergia na inibição contra as cepas patógenas são boas candidatas para a elaboração de productos probióticos multicepa para prevenir e tratar infecções bacterianas específicas.

Resumen Una de las propiedades biológicas más notables atribuidas a los probióticos es su actividad antimicrobiana. La investigación sobre probióticos se ha centrado tradicionalmente en cepas individuales, sin embargo, las combinaciones de cepas probióticas pueden tener un espectro de acción más amplio o efectos sinérgicos, potenciando su acción protectora. El objetivo de esta investigación fue evaluar efecto sinérgico de cepas de bacterias lácticas aisladas de leche materna de diferentes orígenes sobre la inhibición de patógenos bacterianos de importancia en medicina humana y animal. Se emplearon combinaciones de siete cepas de bacterias lácticas juntadas en pares y se estudió su efecto inhibitorio sobre los patógenos bacterianos Escherichia coli ATCC 25922, Salmonella enterica ATCC 13076, Klebsiella pneumoniae ATCC 13883, y Acinetobacter baumannii ATCC 19606 y una cepa de E. coli enterohemorrágica. La combinación de las cepas TUCO-5E + TUCO-L2 fue la más efectiva en la inhibición del desarrollo de todos los patógenos evaluados, destacando su efecto sobre K. pneumoniae y A. baumannii. Cinco de las combinaciones evaluadas mostraron efectos sinérgicos en la inhibición de patógenos extraintestinales: a) se observó efecto sinérgico entre las cepas TUCO-5E + TUCO-L2 para la inhibición de K. pneumoniae . A. baumannii, b) efecto sinérgico para TUCO-5E + TUCO-2, TUCO-5 + TUCO-2, y TUCO-3 + TUCO-17 sobre K. pneumoniae y, c) efecto sinérgico para TUCO-16 + TUCO-17 sobre A. baumannii. Las combinaciones que mostraron sinergia en el efecto antimicrobiano son buenas candidatas para el desarrollo de probióticos multicepa para la prevención y el tratamiento de infecciones bacterianas específicas.

Abstract One of the most notable biological properties attributed to probiotics is their antimicrobial activity. Probiotics research has traditionally been focused on single strains, however, probiotic strains combinations can have a broader spectrum of action or synergistic effects, enhancing their protective action. The objective of this research was to evaluate the synergistic effect of lactic acid bacteria isolated from breast milk of different origins on the inhibition of bacterial pathogens of importance in human and animal medicine. Combinations of seven strains of lactic acid bacteria paired together were used and their inhibitory effect on bacterial pathogens Escherichia coli ATCC 25922, Salmonella enterica ATCC 13076, Klebsiella pneumoniae ATCC 13883, Acinetobacter baumannii ATCC 19606 and an enterohemorragic E. coli strain was investigated. The combination TUCO-5E + TUCO-L2 was the most effective in inhibiting the growth of all pathogens evaluated, highlighting its effect on K. pneumoniae y A. baumannii. Five of the evaluated combinations showed synergistic effects in the inhibition of extraintestinal pathogens: a) a synergistic effect was observed between strains TUCO-5E + TUCO-L2 for the inhibition of K. pneumoniae and A. baumannii, b) synergistic effect for TUCO-5E + TUCO-2, TUCO-5 + TUCO-2, and TUCO-3 + TUCO-17 on K. pneumoniae and, c) synergistic effect for TUCO-16 + TUCO-17 on A. baumannii. The combinations that showed synergy in the antimicrobial effect are good candidates for the development of multistrain probiotics for the prevention and treatment of specific bacterial infections.

SUMMARY The objective of this work was to study the combination of Azospirillum argentinense Az39 with pre and post-emergent herbicides, Acetochlor and Dicamba, for its application both in vitro, and in germination and vegetative stage in maize plants. Az39 survival was determined in the presence of the herbicides added to the culture medium, with and without the addition of carbon or nitrogen sources. In maize seeds, treated with both herbicides, with and without bacterial inoculation, the effect on early development and morpho-physiological variables in stage V5 was evaluated. The tests determined that Az39 survived the presence of both herbicides and used Dicamba as a carbon source. The germination percentage decreased when Acetochlor was applied, while Dicamba inhibited root development. In V5, a decrease in the dry weight of the aerial and root parts of plants treated with Acetochlor was observed, even in the presence of Az39. Bacterial inoculation and/or herbicide application did not show changes in membrane damage, total chlorophylls and carotenoids. This new knowledge promotes the use of native bacterial strains that promote plant growth for their complementary benefits in the development of sustainable practices in crop production.

RESUMEN El objetivo de este trabajo fue estudiar la combinación de Azospirillum argentinense Az39 con herbicidas pre y post-emergentes, Acetoclor y Dicamba, para su aplicación tanto in vitro como en germinación y estadio vegetativo en plantas de maíz. Se determinó la supervivencia de Az39 en presencia de los herbicidas agregados al medio de cultivo con y sin la adición de fuentes de carbono o nitrógeno. En semillas de maíz, tratadas con ambos herbicidas con y sin la inoculación bacteriana, se evaluó el efecto en el desarrollo temprano y variables morfosiológicas en estadio V5. Los ensayos determinaron que Az39 sobrevivió a la presencia de ambos herbicidas y utilizó a Dicamba como fuente de carbono. El porcentaje de germinación disminuyó con la aplicación de Acetoclor, mientras que Dicamba inhibió el desarrollo radical. En V5, se observó una disminución del peso seco de la parte aérea y radical de las plantas tratadas con Acetoclor, aun en presencia de Az39. La inoculación bacteriana y/o la aplicación de herbicidas, no evidenciaron modificaciones en el daño de membranas, clorofilas totales y carotenos. Estos nuevos hallazgos promueven el empleo de cepas bacterianas nativas promotoras del crecimiento vegetal por sus beneficios complementarios en prácticas sustentables en la producción de cultivos.

Abstract Background: The emergence of multidrug-resistant NDM-1-producing enterobacteriaceae strains has become a threat to inpatients, especially to immunosuppressed ones, such as kidney transplant recipients. NDM-1 is a carbapenemase that makes gram-negative bacteria resistant to many types of antibiotics. The incidence of carbapenemase-producing enterobacteria infection in solid organ transplant recipients is around 3 to 10%, with a mortality rate of up to 30%. Methods: We present a case series of 4 patients with NDM-1-producing enterobacteria isolated in urine cultures or rectal swabs. We also conducted a cross-sectional study 30 days after patient identification, collecting surveillance cultures (rectal swab) from all inpatients to assess the extent of spread of this resistance mechanism; a total of 101 patients were included. Results: Two patients were adequately treated with negative control cultures. The other two patients were not treated because they were asymptomatic and had subsequent negative urine cultures. No new colonization was identified in the cross-sectional screening, and no new cases of urinary NDM-1 infection were recorded after a 4-year follow-up. Conclusion: Surveillance for infections caused by multidrug-resistant strains in hospitals treating immunosuppressed patients should be continued and prompt action should be taken in cases of outbreaks of multidrug-resistant infections.

Resumo Histórico: O surgimento de cepas multirresistentes de enterobacteriaceae produtoras de NDM-1 tornou-se uma ameaça para pacientes hospitalizados, especialmente para os imunossuprimidos, como os receptores de transplante renal. NDM-1 é uma carbapenemase que torna as bactérias gram-negativas resistentes a muitos tipos de antibióticos. A incidência de infecção por enterobactérias produtoras de carbapenemas em receptores de transplante de órgãos sólidos é de cerca de 3 a 10%, com uma taxa de mortalidade de até 30%. Métodos: Apresentamos uma série de casos de 4 pacientes com enterobactérias produtoras de NDM-1 isoladas em culturas de urina ou esfregaços retais. Também realizamos um estudo transversal 30 dias após a identificação do paciente, coletando culturas de vigilância (esfregaço retal) de todos os pacientes internados para avaliar a extensão de disseminação deste mecanismo de resistência; foram incluídos um total de 101 pacientes. Resultados: Dois pacientes foram tratados adequadamente com culturas de controle negativo. Os outros dois pacientes não foram tratados porque eram assintomáticos e tiveram culturas de urina negativas subsequentes. Não foi identificada nenhuma nova colonização na triagem transversal, e não foram registrados novos casos de infecção urinária por NDM-1 após um acompanhamento de 4 anos. Conclusão: A vigilância de infecções causadas por cepas multirresistentes em hospitais que tratam pacientes imunossuprimidos deve ser continuada e devem ser tomadas medidas imediatas em casos de surtos desses tipos de infecções.

RESUMEN Objetivo. Comparar las características epidemiológicas de la resistencia a los antimicrobianos en cepas bacterianas aisladas de muestras de pacientes de servicios hospitalarios y ambulatorios en Ecuador. Métodos. Se realizó un análisis secundario de los datos sobre cepas bacterianas aisladas en muestras de pacientes de servicios hospitalarios y ambulatorios. Se recogieron los datos de la base de datos nacional del 2018 para la vigilancia de la resistencia a los antimicrobianos del Centro de Referencia Nacional para la Resistencia a los Antimicrobianos. Las variables incluidas fueron: edad, sexo, entorno hospitalario frente a entorno ambulatorio, tipo de muestra, especies bacterianas detectadas, patrón de resistencia a los antibióticos y zona geográfica. Resultados. En el estudio se incluyeron datos de 57 305 cepas aislamientos bacterianos: 48,8% fueron de pacientes hospitalizados, 55,7% fueron de mujeres y 60,1% fueron de pacientes mayores de 45 años. La orina (42,9%) y la sangre (12,4%) fueron las muestras clínicas más comunes. En general, 77,1% de las cepas bacterianas aisladas fueron gramnegativas (83% y 71% en pacientes de servicios ambulatorios y hospitalarios, respectivamente). Las especies grampositivas y gramnegativas más comunes fueron Staphylococcus aureus y Escherichia coli, respectivamente. Los niveles de resistencia a los antimicrobianos fueron elevados (hasta 80% en el caso de algunos fármacos antimicrobianos) y fueron más elevados en los pacientes de servicios hospitalarios en comparación con los pacientes de servicios ambulatorios. Se encontró que una variedad de carbapenemasas confiere resistencia a los carbapenémicos (antibióticos de último recurso) en bacterias gramnegativas. Conclusiones. Los resultados del estudio proporcionan una línea de base importante sobre la resistencia a los antimicrobianos en Ecuador, que permitirá el fortalecimiento de las directrices del sistema de vigilancia, la creación de políticas públicas para la estandarización de los métodos de laboratorio, una adecuada gestión de la información y la elaboración de orientaciones de tratamiento empírico basadas en las características epidemiológicas locales.

RESUMO Objetivo. Comparar a epidemiologia da resistência aos antimicrobianos em bactérias isoladas de amostras hospitalares e ambulatoriais no Equador. Métodos. Foi feita uma análise secundária de dados sobre bactérias isoladas de amostras hospitalares e ambulatoriais. Os dados foram obtidos do banco de dados nacional de vigilância da resistência aos antimicrobianos de 2018 do Centro Nacional de Referência para a Resistência aos Antimicrobianos. As variáveis incluídas foram: idade, sexo, ambiente hospitalar versus ambiente ambulatorial, tipo de espécime, espécies bacterianas identificadas, padrão de resistência a antibióticos e área geográfica. Resultados. Foram incluídos no estudo os dados de 57 305 isolados bacterianos: 48,8% eram de pacientes hospitalizados, 55,7% eram de mulheres e 60,1% eram de pacientes com mais de 45 anos. As amostras clínicas mais comuns foram urina (42,9%) e sangue (12,4%). No total, 77,1% dos isolados bacterianos eram gram-negativos (83% e 71% em pacientes ambulatoriais e pacientes internados, respectivamente). As espécies gram-positivas e gram-negativas mais comuns foram Staphylococcus aureus e Escherichia coli, respectivamente. Os níveis de resistência aos antimicrobianos foram elevados (até 80% para alguns antimicrobianos) e foram mais elevados em pacientes hospitalizados em comparação com pacientes ambulatoriais. Foram encontradas várias carbapenemases que conferem resistência aos carbapenêmicos (antibióticos de último recurso) em bactérias gram-negativas. Conclusões. Os resultados do estudo fornecem uma importante linha de base sobre a resistência aos antimicrobianos no Equador. Isto permitirá o fortalecimento das diretrizes do sistema de vigilância, a criação de políticas públicas para padronização de metodologias laboratoriais, o manejo adequado de informações e o desenvolvimento de diretrizes para a antibioticoterapia empírica com base na epidemiologia local.

ABSTRACT Objective. To compare the epidemiology of antimicrobial resistance in bacteria isolated from inpatient and outpatient samples in Ecuador. Methods. A secondary analysis was done of data on bacteria isolated from inpatient and outpatient samples. Data were taken from the 2018 national antimicrobial resistance surveillance database of the National Reference Center for Antimicrobial Resistance. The variables included were: age, sex, inpatient versus outpatient setting, type of specimen, bacterial species identified, pattern of resistance to antibiotics, and geographic area. Results. Data from 57 305 bacterial isolates were included in the study: 48.8% were from hospitalized patients, 55.7% were from women, and 60.1% were from patients older than 45 years. Urine (42.9%) and blood (12.4%) were the most common clinical samples. Overall, 77.1% of bacterial isolates were gram-negative (83% and 71% in outpatients and inpatients, respectively). The most common gram-positive and gram-negative species were Staphylococcus aureus and Escherichia coli, respectively. Antimicrobial resistance levels were high (up to 80% for some antimicrobial drugs), and were higher in hospitalized patients compared with outpatients. A variety of carbapenemases were found to confer resistance to carbapenems (antibiotics of last resort) in gram-negative bacteria. Conclusions. The study findings provide an important baseline on antimicrobial resistance in Ecuador. This will allow the strengthening of guidelines of the surveillance system, the creation of public policies for standardization of laboratory methodologies, the proper handling of information, and the development of empirical therapy guidelines based on local epidemiology.

RESUMEN Objetivo. Evaluar los cambios en la resistencia a los antibióticos de ocho de las combinaciones de fármacos y agentes patógenos incluidos en la lista prioritaria de la Organización Mundial de la Salud y el consumo de seis antibióticos (ceftriaxona, cefepima, piperacilina/tazobactam, meropenem, ciprofloxacina, vancomicina) antes de la pandemia de COVID-19 (de marzo del 2018 a julio del 2019) y durante la pandemia (de marzo del 2020 a julio del 2021) en 31 hospitales del Valle del Cauca (Colombia). Métodos. En este estudio se analiza el antes y el después empleando datos recopilados de forma rutinaria. Para el consumo de antibióticos, se compararon las dosis diarias definidas (DDD) por 100 días-cama. Resultados. Hubo 23 405 cepas bacterianas aisladas prioritarias con datos sobre la resistencia a los antibióticos. El número total de cepas aisladas aumentó de 9 774 antes de la pandemia a 13 631 durante la pandemia. Si bien la resistencia disminuyó significativamente en las cuatro combinaciones seleccionadas de agentes patógenos y fármacos (Klebsiella pneumoniae, productora de betalactamasa de espectro extendido [BLEE], de 32% a 24%; K. pneumoniae, resistente a los carbapenémicos, de 4% a 2%; Pseudomonas aeruginosa, resistente a los carbapenémicos, de 12% a 8%; Acinetobacter baumannii, resistente a los carbapenémicos, de 23% a 9%), el nivel de resistencia de Enterococcus faecium a la vancomicina aumentó significativamente (de 42% a 57%). No hubo cambios en la resistencia en las tres combinaciones restantes (Staphylococcus aureus, resistente a la meticilina; Escherichia coli, productora de BLEE; E. coli, resistente a los carbapenémicos). El consumo de todos los antibióticos aumentó. Sin embargo, el consumo de meropenem disminuyó en los entornos de las unidades de cuidados intensivos (de 8,2 a 7,1 DDD por 100 días-cama). Conclusiones. Aunque el consumo de antibióticos aumentó, se observó una disminución en la resistencia a los antibióticos de cuatro combinaciones de agentes patógenos y medicamentos durante la pandemia, que posiblemente se debió a un aumento en las infecciones adquiridas en la comunidad. Es necesario vigilar el aumento de la resistencia de E. faecium a la vancomicina. Los resultados de este estudio son esenciales para que sirvan de orientación en los programas de optimización del uso de los antibióticos en los entornos hospitalarios de Colombia y en contextos similares en otros lugares.

RESUMO Objetivo. Avaliar as mudanças na resistência a antibióticos em oito das combinações microrganismo/antimicrobiano prioritárias da Organização Mundial da Saúde e o consumo de seis antibióticos (ceftriaxona, cefepima, piperacilina/tazobactam, meropeném, ciprofloxacino, vancomicina) antes (março de 2018 a julho de 2019) e durante (março de 2020 a julho de 2021) a pandemia de COVID-19 em 31 hospitais em Valle del Cauca, Colômbia. Métodos. Este foi um estudo antes/depois utilizando dados coletados rotineiramente. Para avaliar o consumo de antibióticos, foram comparadas doses diárias definidas (DDD) por 100 leitos-dias. Resultados. Havia dados sobre resistência a antibióticos para 23.405 isolados bacterianos prioritários. O número total de isolados aumentou de 9.774 para 13.631 antes e durante a pandemia, respectivamente. Embora a resistência tenha diminuído significativamente para quatro das combinações microrganismo/antimicrobiano selecionadas (Klebsiella pneumoniae, produtora de betalactamase de espectro estendido [ESBL], 32% a 24%; K. pneumoniae, resistente a carbapenêmicos, 4% a 2%; Pseudomonas aeruginosa, resistente a carbapenêmicos, 12% a 8%; Acinetobacter baumannii, resistente a carbapenêmicos, 23% a 9%), o nível de resistência de Enterococcus faecium a vancomicina aumentou significativamente (42% a 57%). Não houve mudança na resistência para as três combinações restantes (Staphylococcus aureus, resistente a meticilina; Escherichia coli, produtora de ESBL; E. coli, resistente a carbapenêmicos). O consumo de todos os antibióticos aumentou. Entretanto, o consumo de meropeném nas unidades de terapia intensiva diminuiu (de 8,2 para 7,1 DDD por 100 leitos-dias). Conclusões. Embora o consumo de antibióticos tenha aumentado, observou-se uma diminuição na resistência a antibióticos de quatro combinações microrganismo/antimicrobiano durante a pandemia. Isso ocorreu possivelmente devido a um aumento nas infecções adquiridas na comunidade. O aumento da resistência de E. faecium à vancomicina deve ser monitorado. Os achados deste estudo são essenciais para guiar os programas de gerenciamento de antimicrobianos em ambientes hospitalares da Colômbia e em outros contextos similares.

ABSTRACT Objective. To assess changes in antibiotic resistance of eight of the World Health Organization priority bug-drug combinations and consumption of six antibiotics (ceftriaxone, cefepime, piperacillin/tazobactam, meropenem, ciprofloxacin, vancomycin) before (March 2018 to July 2019) and during (March 2020 to July 2021) the COVID-19 pandemic in 31 hospitals in Valle del Cauca, Colombia. Methods. This was a before/after study using routinely collected data. For antibiotic consumption, daily defined doses (DDD) per 100 bed-days were compared. Results. There were 23 405 priority bacterial isolates with data on antibiotic resistance. The total number of isolates increased from 9 774 to 13 631 in the periods before and during the pandemic, respectively. While resistance significantly decreased for four selected bug-drug combinations (Klebsiella pneumoniae, extended spectrum beta lactamase [ESBL]-producing, 32% to 24%; K. pneumoniae, carbapenem-resistant, 4% to 2%; Pseudomonas aeruginosa, carbapenem-resistant, 12% to 8%; Acinetobacter baumannii, carbapenem-resistant, 23% to 9%), the level of resistance for Enterococcus faecium to vancomycin significantly increased (42% to 57%). There was no change in resistance for the remaining three combinations (Staphylococcus aureus, methicillin-resistant; Escherichia coli, ESBL-producing; E. coli, carbapenem-resistant). Consumption of all antibiotics increased. However, meropenem consumption decreased in intensive care unit settings (8.2 to 7.1 DDD per 100 bed-days). Conclusions. While the consumption of antibiotics increased, a decrease in antibiotic resistance of four bug-drug combinations was observed during the pandemic. This was possibly due to an increase in community-acquired infections. Increasing resistance of E. faecium to vancomycin must be monitored. The findings of this study are essential to inform stewardship programs in hospital settings of Colombia and similar contexts elsewhere.